aaaaa


Genel Bilgiler

Yayın Türü Hakemli Konferans/Sempozyumların Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar ISSN Numarası
Elektronik ISSN Numarası Yayın Tarihi 2021

Detaylar

Yayın Adı Spinosada Maruz Kalmış Domates Yaprak Güvesi [Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae)]’nde İfadesi Değişen Genlerin Transkriptom Temelli Tespiti Dergi Adı 8. Uluslararası Katılımlı Bitki Koruma Kongresi, 24-28 Ağustos 2021, Bolu, Türkiye
Dergi Cilt No
Özet Domatesin en önemli zararlılarından birisi olan domates güvesi [Tuta absoluta (Meyrick, 1917) (Lepidoptera: Gelechiidae)]’nin savaşımında kimyasal mücadele ön plana çıkmaktadır. Ancak insektisit direnci spinosad gibi mevcut ilaçların etkinliklerini tehlikeye atmaktadır. T. absoluta’da spinosad hedef-bölge direnci son yapılan çalışmalarda ortaya koyulmuş olmasına rağmen spinosad uygulaması sonrasında ifadesi değişen genlerin ve bu genlerin insektisit direncinde dahil oldukları yolaklara ilişkin bir çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmada, 022 nolu IRAC test metoduna uygun şekilde, Antalya’daki bir domates serasından toplanan Serik popülasyonu, spinosada karşı hassas TA1 popülasyonuna göre 17 kat dirençli bulunmuştur. Ardından spinosad uygulamasının Serik popülasyonundaki gen ekspresyon profili değişimine etkisi RNA-seq metodu kullanarak belirlenmiştir. Uygulamadan (TA1 için LC99 : 29 ppm) 72 saat sonra hayatta kalan bireylerden ve kontrol grubundan 10'ar larva 3'er tekerrürlü olacak şekilde havuzlanmış ve RNA izolasyonları gerçekleştirilmiştir. Transkriptom analizi için Illumina platformu (2x150 bp, >20 M okuma) kullanılmıştır. Karşılaştırmalı analiz sonucunda 162,626 adet transkriptten 1,489 bç N50 değerine sahip 57,043 adet unigen (her genin en uzun transkripti) elde edilmiştir. Toplamda 1,155 adet unigenin ifadesi değişirken bunlardan 299 adet unigenin ifadesi artmış 856 adet unigenin ise ifadesi azalmıştır. Söz konusu unigenler GO ve KEGG veritabanlarındaki fonksiyonel sınıflandırmaları sonucunda 20 adet GO terimi ve 39 adet KEGG yolağına dahil olmuştur (p<0.05). Ek olarak, ifadesi değişen unigenler içerisinde bilinen detoksifikasyon genleri (sitokrom p450 ve glutatyon S-transferaz), ısı şok proteinleri, kütiküla ve proteaz genleri gibi insektisit direncinde rol oynayan çok sayıda gen yer almıştır. Ancak uygulama grubunda spinosad hedef-bölge direnci ile ilişkilendirilmiş herhangi bir genetik değişiklik tespit edilememiştir. Bu durum Serik popülasyonu spinosad direncinde çoklu ancak spesifik genlerin rol oynadığını göstermektedir. Elde edilen transkriptomik kaynak T. absoluta’daki spinosad metabolik direncinde rol oynayan kompleks mekanizmasının araştırılması için önemli bir başlangıç noktası oluşturmaktadır.

Kurum İçi Yazarlar

Adı Soyadı Kısa Adı
Abdullah Emre ATIŞ Atış AE.
Duygu DEMİRÖZ Demiröz D.
Dr. Abdullah YILMAZ Yılmaz A.
Erkan ÖZEL Özel E.
Başak COŞKUN Coşkun B.

Kurum Dışı Yazarlar

Adı Soyadı Kısa Adı
Ali ERGÜL Ergül A.

Ekler

Dosya Adı